Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK8P49336 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK8P49336 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK8P49336 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK8P49336 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK8P49336 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK8P49336 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms