Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCLCP48506 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCLCP48506 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCLCP48506 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCLCP48506 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCLCP48506 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLCP48506 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLCP48506 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLCP48506 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLCP48506 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLCP48506 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCLCP48506 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCLCP48506 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCLCP48506 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCLCP48506 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms