Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GJA8P48165 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GJA8P48165 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GJA8P48165 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GJA8P48165 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GJA8P48165 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GJA8P48165 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GJA8P48165 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GJA8P48165 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GJA8P48165 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms