Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NKX2-1P43699 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NKX2-1P43699 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms