Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP6V1E1P36543 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP6V1E1P36543 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms