Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDE6BP35913 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDE6BP35913 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDE6BP35913 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms