Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MYH11P35749 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MYH11P35749 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MYH11P35749 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MYH11P35749 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MYH11P35749 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MYH11P35749 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms