Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA4P35212 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJA4P35212 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJA4P35212 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA4P35212 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA4P35212 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA4P35212 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA4P35212 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GJA4P35212 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GJA4P35212 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms