Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ABCC1P33527 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
ABCC1P33527 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
ABCC1P33527 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms