Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CHRNA3P32297 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA3P32297 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms