Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRIP30626 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRIP30626 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SRIP30626 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SRIP30626 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRIP30626 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRIP30626 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SRIP30626 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms