Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPRMP28827 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPRMP28827 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTPRMP28827 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
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