Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SSFA2P28290 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSFA2P28290 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms