Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMB5P28074 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSMB5P28074 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms