Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4BP23588 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms