Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KB1P23443 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPS6KB1P23443 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms