Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ERBB3P21860 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ERBB3P21860 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms