Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCP20941 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCP20941 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCP20941 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCP20941 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCP20941 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCP20941 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCP20941 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCP20941 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCP20941 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCP20941 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms