Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRHP20396 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRHP20396 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRHP20396 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRHP20396 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TRHP20396 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRHP20396 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRHP20396 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRHP20396 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRHP20396 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRHP20396 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
TRHP20396 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRHP20396 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRHP20396 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRHP20396 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRHP20396 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRHP20396 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRHP20396 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TRHP20396 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms