Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPI1P17947 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPI1P17947 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SPI1P17947 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SPI1P17947 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SPI1P17947 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPI1P17947 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPI1P17947 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPI1P17947 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPI1P17947 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SPI1P17947 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPI1P17947 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPI1P17947 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPI1P17947 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPI1P17947 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPI1P17947 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms