Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNB2P17787 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNB2P17787 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms