Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMPD1P17405 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMPD1P17405 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD1P17405 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms