Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCSHP14314 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCSHP14314 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms