Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GP1BBP13224 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms