Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NEFHP12036 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NEFHP12036 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NEFHP12036 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NEFHP12036 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NEFHP12036 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NEFHP12036 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms