Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD28P10747 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD28P10747 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD28P10747 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CD28P10747 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms