Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MMP10P09238 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MMP10P09238 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP10P09238 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP10P09238 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP10P09238 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MMP10P09238 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MMP10P09238 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MMP10P09238 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP10P09238 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP10P09238 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP10P09238 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MMP10P09238 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP10P09238 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP10P09238 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP10P09238 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MMP10P09238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MMP10P09238 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP10P09238 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP10P09238 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP10P09238 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP10P09238 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MMP10P09238 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms