Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGPP08493 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGPP08493 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGPP08493 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGPP08493 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGPP08493 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MGPP08493 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MGPP08493 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
MGPP08493 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MGPP08493 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MGPP08493 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MGPP08493 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms