Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RHOP08100 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOP08100 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOP08100 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOP08100 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOP08100 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RHOP08100 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RHOP08100 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RHOP08100 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RHOP08100 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RHOP08100 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RHOP08100 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms