Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LPLP06858 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LPLP06858 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LPLP06858 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LPLP06858 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPLP06858 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPLP06858 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPLP06858 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LPLP06858 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LPLP06858 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LPLP06858 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms