Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTMAP06454 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTMAP06454 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTMAP06454 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTMAP06454 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTMAP06454 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTMAP06454 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTMAP06454 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTMAP06454 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTMAP06454 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTMAP06454 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTMAP06454 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms