Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB4AP04350 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBB4AP04350 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms