Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOC1P02654 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOC1P02654 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOC1P02654 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOC1P02654 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOC1P02654 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms