Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IGHV3-7P01780 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGHV3-7P01780 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms