Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASS1P00966 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ASS1P00966 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ASS1P00966 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ASS1P00966 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ASS1P00966 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ASS1P00966 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASS1P00966 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ASS1P00966 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASS1P00966 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms