Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DDX58O95786 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DDX58O95786 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX58O95786 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX58O95786 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX58O95786 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX58O95786 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX58O95786 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DDX58O95786 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DDX58O95786 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX58O95786 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX58O95786 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX58O95786 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms