Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG7O95352 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG7O95352 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATG7O95352 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATG7O95352 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG7O95352 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG7O95352 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG7O95352 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG7O95352 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG7O95352 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG7O95352 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG7O95352 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG7O95352 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms