Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ATG12O94817 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATG12O94817 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG12O94817 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG12O94817 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG12O94817 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATG12O94817 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATG12O94817 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATG12O94817 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms