Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ECM2O94769 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ECM2O94769 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ECM2O94769 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ECM2O94769 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ECM2O94769 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ECM2O94769 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ECM2O94769 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ECM2O94769 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms