Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCNKO75909 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCNKO75909 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCNKO75909 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCNKO75909 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms