Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPN15O75808 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPN15O75808 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms