Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMO75781 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMO75781 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMO75781 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMO75781 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMO75781 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMO75781 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMO75781 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMO75781 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMO75781 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMO75781 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALMO75781 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms