Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45BO75293 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45BO75293 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms