Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
SYNCRIPO60506 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNCRIPO60506 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms