Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SYNGR2O43760 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SYNGR2O43760 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms