Protein–RNA interactions for Protein: O43555

GNRH2, Progonadoliberin-2, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNRH2O43555 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GNRH2O43555 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms