Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SART1O43290 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SART1O43290 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SART1O43290 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SART1O43290 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SART1O43290 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SART1O43290 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SART1O43290 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SART1O43290 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms