Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZBTB39O15060 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBTB39O15060 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms