Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GFRA2O00451 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA2O00451 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms