Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DFFAO00273 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DFFAO00273 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DFFAO00273 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DFFAO00273 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DFFAO00273 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DFFAO00273 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DFFAO00273 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DFFAO00273 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DFFAO00273 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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